熒光基團通常各自擁有單一的光吸收峰。在光的刺激下，熒光基團吸收光的能量后通常以三種方式釋放出能量：

　　1.光能：許多熒光基團吸收光能后仍舊以光能形式釋放能量，并且發(fā)射光的峰值大于吸收峰。

　　2.熱能：某些熒光基團吸收光能后，能量轉(zhuǎn)換為熱量擴散到環(huán)境中。

　　3.轉(zhuǎn)移給臨近的分子：當(dāng)臨近的分子滿足發(fā)生能量轉(zhuǎn)移的要求時，能量從熒光基團傳遞到臨近的分子。

　　當(dāng)某個熒光基團的發(fā)射譜與另一熒光基團的吸收光譜發(fā)生重疊，且兩個基團距離足夠近時，能量可以從短波長（高能量）的熒光基團傳遞到長波長（低能量）的熒光基團，這個過程稱為熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)，實際相當(dāng)于將短波長熒光基團釋放的熒光屏蔽。

　　熒光-PCR法區(qū)別于其他PCR法主要有以下優(yōu)點：

　　1.全封閉反應(yīng)，無需PCR后處理；

　　2.特異性強，靈敏度高；

　　3.采用對數(shù)期分析，摒棄終點數(shù)據(jù)，定量準(zhǔn)確；

　　4.定量范圍寬，可達(dá)到10個數(shù)量級；

　　5.儀器在線式實時監(jiān)測，結(jié)果直觀，避免人為判斷；

　　6.可實現(xiàn)一管雙檢或多檢；

　　7.操作安全，縮短時間，提高效率；

　　8.利于自動化和聯(lián)網(wǎng)管理。